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元宝枫AP2/ERF基因功能研究取得新进展（图）
元宝枫 AP2 ERF 基因功能
2023/5/30
元宝枫（Acer truncatumBunge），属槭树科（Aceraceae）槭树属（Acer），因翅果形状像“金锭元宝”而得名，其抗旱、节水性能力强，是太行山石质山区和黄土丘陵区域重要的造林树种。APETALA2/Ethylene Responsive Factor (AP2/ERF)在植物抵御非生物胁迫中起着关键作用，然而对于元宝枫AP2/ERF的功能却不清楚。
元宝枫（Acer truncatum Bunge），属槭树科（Aceraceae）槭树属（Acer），因翅果形状像“金锭元宝”而得名，其抗旱、节水性能力强，是太行山石质山区和黄土丘陵区域重要的造林树种。APETALA2/Ethylene Responsive Factor (AP2/ERF)在植物抵御非生物胁迫中起着关键作用，然而对于元宝枫AP2/ERF的功能却不清楚。
白桦AP2/ERF家族基因的生物信息学分析
AP2/ERF 家族 生物信息学 转录因子 白桦
2021/7/13
从白桦转录组数据库中筛选出45条AP2/ERF家族蛋白,对其蛋白序列进行生物信息学分析和系统进化分析。结果表明,白桦AP2/ERF蛋白除了分为AP2、ERF、RAV和soloist家族外,还有2条蛋白不属于这些家族;不同组别白桦AP2/ERF蛋白在理化性质上存在差异;白桦AP2/ERF蛋白都含有磷酸化位点,但含有磷酸化位点的数量和种类上都有差异;白桦AP2/ERF蛋白大都定位在细胞核里,它们主要在...
枣AP2/ERF转录因子鉴定及其响应枣疯病植原体表达分析
枣 枣疯病 植原体 AP2/ERF转录因子
2020/9/14
利用生物信息学方法，从植物转录因子数据库和NCBI数据库中分别得到175和164个候选的枣AP2/ERF转录因子序列，使用DNAMAN软件进行序列比对、去除重复序列，采用SMART软件预测蛋白结构域发现，枣基因组中包含有145个AP2/ERF基因，其中ERF、AP2、RAV亚家族分别含有116个、23个、5个，另有1个独立基因。预测枣AP2/ERF转录因子氨基酸数量在111 ~ 692之间，分子量...
基于番茄基因组数据库的更新，系统地对番茄AP2/ERF超家族成员进行了更新，并对其进行了染色体定位、保守基序、基因结构和对灰霉菌及生长素胁迫响应的分析。共鉴定出141个ERF家族基因，其中新鉴定出的ERF亚家族成员42个；随机分布在12条染色体上，大都只含有外显子而无内含子，部分基因不同程度的受到灰霉菌和生长素处理的诱导表达。作为拟南芥AtERF109在番茄中的同源基因，SlERF.D.3的表达可...
用RT-PCR方法从‘大辣椒’蝴蝶兰叶片中克隆得到4个AP2/ERF家族基因，命名为PhAP2/ERF1 ~ PhAP2/ERF4。蛋白结构域和序列比对发现PhAP2/ERF1 ~ PhAP2/ERF4均含有1个AP2结构域， PhAP2/ERF2还含有1个B3结构域。进化树分析表明4个蛋白与兰科AP2/ERF家族成员亲缘关系最近，PhAP2/ERF1属于AP2/ERF家族DREB亚家族中的A1类...
小豆AP2/ERF基因家族鉴定及其应答锈菌侵染的表达分析
小豆 小豆锈病 豇豆单胞锈菌 转录因子
2020/9/2
为明确小豆VaAP2/ERF家族基因在小豆应答豇豆单胞锈菌(Uromyces vignae)侵染中的作用,本研究采用生物信息学方法从小豆基因组中鉴定VaAP2/ERFs家族基因186个,包括AP2(24个)、RAV(2个)、Soloist(1个)及ERF(159个)四个亚家族,其中ERF亚家族又可分为DREB和ERF两个亚类。基因结构分析发现,68.3%的VaAP2/ERFs基因不具内含子。保守基...
14个苹果AP2/ERF转录因子基因的克隆与表达分析
苹果 AP2/ERF转录因子 序列分析 表达分析
2020/4/8
为探究AP2/ERF转录因子在苹果(Malus pumila Mill.)生长发育以及生物或非生物胁迫应答下的功能,本研究利用同源比对和逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)方法,克隆苹果MdAP2/ERF全长cDNA序列并进行生物信息学分析。采用Array技术检测MdAP2/ERF在苹果16种不同组织中的表达情况,RNA-seq技术检测MdAP2/ERF在苹果斑点落叶病菌(Alternaria a...
调控黄瓜苦味基因Bi的AP2/ERF家族转录因子
黄瓜 苦味 酵母单杂交 烟草瞬时表达 AP2/ERF转录因子
2014/6/13
从华北型黄瓜‘9930’中克隆了黄瓜苦味形成的关键基因Bi的启动子序列，通过酵母单杂交技术对黄瓜叶片cDNA文库进行筛选，寻找可以调控Bi表达的转录因子。通过对筛选结果的测序及比对，发现有7种转录因子重复出现，包括2个AP2/ERF家族、3个bZIP家族、1个WRKY家族转录因子和1个E3泛素类COP1蛋白。其中AP2/ERF家族转录因子CsERF（登录号：Csa7M448110）重复出现6次，出...
植物AP2/ERF类转录因子研究进展
AP2/ERF转录因子 生物学功能 研究进展
2012/8/6
植物AP2/ERF是一个庞大的转录因子基因家族, 含有由60~70个氨基酸组成的AP2/ERF结构域而得名, 存在于所有的植物中。AP2/ERF转录因子参与多种生物学过程, 包括植物生长、花发育、果实发育、种子发育、损伤、病菌防御、高盐、干旱等环境胁迫响应等。AP2/ERF类转录因子参与水杨酸、茉莉酸、乙烯、脱落酸等多种信号转导途径, 而且是逆境信号交叉途径中的连接因子。文章对国内外近年来有关植物...
植物AP2/ERF类转录因子研究进展
AP2/ERF转录因子 生物学功能 研究进展
2013/7/22
植物AP2/ERF是一个庞大的转录因子基因家族, 含有由60~70个氨基酸组成的AP2/ERF结构域而得名, 存在于所有的植物中。AP2/ERF转录因子参与多种生物学过程, 包括植物生长、花发育、果实发育、种子发育、损伤、病菌防御、高盐、干旱等环境胁迫响应等。AP2/ERF类转录因子参与水杨酸、茉莉酸、乙烯、脱落酸等多种信号转导途径, 而且是逆境信号交叉途径中的连接因子。文章对国内外近年来有关植物...