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于典司(2021)Genetic diversity and population structure of popcorn germplasm resources using genome-wide SNPs through genotyping-by-sequencing (图)
爆米花 遗传多样性 SNP 爆裂玉米
2023/2/27
上海市农业科学院作物育种栽培研究所玉米研究中心郑洪建团队在Genetic Resources and Crop Evolution发表了题为“Genetic diversity and population structure of popcorn germplasm resources using genome-wide SNPs through genotyping-by-sequencing...
中国水产科学研究院珠江水产研究所《鉴别尖塘鳢鱼种的SNPs及基于SNPs的AS-PCR引物组及其检测方法及应用》获得国家发明专利授权(图)
鉴别 尖塘鳢鱼种 SNPs AS-PCR引物组 检测方法 专利授权(图)
2021/9/10
日前,由中国水产科学研究院珠江水产研究所水产生物技术室樊佳佳、马冬梅、朱华平等发明的“鉴别尖塘鳢鱼种的SNPs及基于SNPs的AS-PCR引物组及其检测方法及应用”获得国家发明专利授权,专利号:ZL202011292975.8。
旨在研究猪RXRB基因多态性位点,并筛选与猪生长育肥和繁殖性状显著相关的SNPs,为种猪的遗传改良提供新的遗传标记位点。本研究通过采集962头健康大白猪(美系大白459头,法系大白503头)的血液DNA,利用直接测序法和PCR-RFLP技术分别检测两个品系大白猪RXRB基因SNP位点,并进行遗传多态性分析。利用SAS 8.0软件中的混合线性模型(Mixed)对RXRB基因SNP位点与表型性状值进行...
旨在克隆和分析水貂酪氨酸酶(tyrosinase,TYR)基因编码区,揭示该基因编码区SNPs及其皮肤组织mRNA差异表达规律与水貂毛色表型的关系。本研究采集7月龄雄性金州黑水貂、名威银蓝水貂和红眼白水貂共计301个样本的血液,利用聚合酶链式反应(PCR)方法对水貂TYR基因5个外显子进行分段克隆,并拼接获得其完整编码区序列(coding sequence,CDS);采用PCR产物直接测序技术筛查...
为获取缢蛏ScHsc70基因单核苷酸多态性位点与耐高温性状的相关性,通过直接测序方法克隆了ScHsc70基因全长序列,长度为4 048 bp,包括6个内含子和7个外显子,编码区1 950 bp,从其外显子区域筛查到6个潜在的SNPs,分别命名为Rs1(g. 588 C>T)、Rs2(g. 840 C>T)、Rs3(g. 885 T>A)、Rs4(g. 1233 A>G)、Rs5(g. 1467 T...
肌球蛋白是肌肉细胞的重要组成成分,影响肌纤维的组成和肌肉生长。为了研究肌球蛋白重链(MYH)基因多态性与大口黑鲈生长性状的相关性,本研究采用PCR技术扩增得到编码区序列全长为9759 bp的大口黑鲈MYH基因,该基因包含37个外显子和36个内含子,编码1940个氨基酸。采用直接测序法在MYH基因上筛选到8个单核苷酸多态性标记(SNP)位点(A-305G、G-558C、A-2784C、A-2816G...
本研究旨在探索新疆褐牛产奶性状相关候选基因多态性与泌乳性状及体细胞评分(SCS)的相关性,探究新疆褐牛多态性位点的群体遗传特征。基于课题组前期DNA混池重测序的结果筛选17个SNPs突变信息,并采用基质辅助激光电离解吸飞行时间质谱法(Sequenom MassArray Genotype)分型技术验证FASN、FSHR、HAL、GPIHBP1、NIBPL、C9、PDE9A、PTK2、STAT1、Z...
旨在探讨生长激素(Growth hormone,GH)、生长激素受体(Growth hormone receptor,GHR)、生长激素促分泌素受体(Growth hormone secretagogue receptor,GHSR)基因在麦洼牦牛中的遗传多样性,揭示不同基因型与其生长性状的关联性,同时为候选基因在牦牛中的表达调控提供理论依据,寻找可用于遗传育种辅助选择的分子标记。本试验采用DNA...
HDAC9基因SNPs与大动脉粥样硬化缺血性卒中的相关性研究
HDAC9基因 SNPs 缺血性卒中
2016/12/21
目的 探讨组蛋白去乙酰化酶9(histone d eacetylase 9,HDAC9)在动脉粥样硬化缺血性卒中易感区域单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)与基因型和生物学表型的相关性。方法 利用Haploview软件和千人基因组计划提供的遗传学数据,对HDAC9基因SNPs位点的最小等位基因频率(minor allele frequency,...
目的:探讨CDH 17表达与胃癌临床病理学特征的关系及其SNPs与胃癌遗传易感性的关系。方法:制作模拟胃癌侵袭转移动态的组织芯片,免疫组织化学SP法检测CDH 17蛋白的表达,PCR-LDR技术检测CDH 17基因2 个SNPs位点rs 2514813和rs 3214050 的多态性并行测序验证。结果:胃癌CDH 17表达上调与组织学分化程度呈正相关(P < 0.01);肠型胃癌表达高于弥漫型胃癌...
Imputation accuracy of bovine spongiform encephalopathy-associated PRNP indel polymorphisms from middle-density SNPs arrays
BSE cattle indel prion gene
2015/7/3
Statistical methods of imputation allow predicting genotypes of markers (which were not genotyped in the whole population) based on known linkage disequilibrium relationships between the flanking poly...
Identification of SNPs in ME1 gene and association analysis with meat
candidate gene polymorphism beef
2015/7/2
The objective of this study was to identify single nucleotide polymorphisms (SNPs) in coding regions of bovine ME1 gene and to evaluate if the polymorphisms are associated with meat quality traits in ...
Novel SNPs of the porcine TRIP12 are associated with water holding capacity of meat
E3 ligase swine drip loss expression ubiquitination protein degradation meat quality
2015/6/24
Degradation of proteins during maturation of meat, mediated by the calpain/calpastatin system and the ubiquitination system, largely affects the tenderness and the water holding capacity (WHC) of meat...