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苏铁nrDNA ITS区的序列多态性：不完全致同进化的证据
Cycas revoluta nrDNA ITS 致同进化 假基因 多态性
2009/10/20
本研究对苏铁(Cycas revoluta) nrDNA ITS进行克隆测序, 并以cDNA ITS为参照, 比较分析获得的序列的碱基变异、GC含量、5.8S二级结构的稳定性和5.8S保守基序的有无以及系统发育关系。结果发现苏铁nrDNA ITS存在较高的基因组内多样性, 同时, 这些分化的nrDNA ITS拷贝中包含有假基因的存在, 而且假基因与功能拷贝之间已经形成了较大的遗传分化, 这暗示...
应用nrDNA ITS和ETS序列探讨了樟科Lauraceae黄肉楠属Actinodaphne的系统演化关系。对得到的3个序列矩阵(ITS、ETS和ITS/ETS), 采用MP (maximum parsimony), ML (maximum likelihood)和Bayesian 3种分析方法进行了系统发育分析。结果显示, 本文选的黄肉楠属Actinodaphne物种与所选的月桂族中的外类群...
运用核糖体DNA内转录间隔区ITS序列对狭蕊龙胆属Metagentiana10种及其近缘属22种植物进行了系统发育分析。ITS分析结果表明狭蕊龙胆属是一个多系群:在系统发育树上,双蝴蝶属Tripterospermum和蔓龙胆属Crawfurdia的种类位于狭蕊龙胆属各分支中,而且双蝴蝶属和蔓龙胆属的种类也相互交叉;这一结果不支持将3个属各自独立为属。但是,在所有分析中,3个属共同形成一单系分支,是...
一种鉴定菜用枸杞的新方法——nrDNA ITS测序法
枸杞属 ITS序列 DNA测序 鉴定
2009/6/17
［目的］〖HTK〗拟从分子水平对菜用枸杞进行鉴定。［方法］〖HTK〗利用nrDNA ITS（核糖体DNA基因内转
录间隔区）碱基序列测定的方法对5份菜用枸杞资源进行碱基序列测定并分析序列差异。［
结果］〖HTK〗首次获得5种菜用枸杞nrDNA ITS区碱基序列，整个ITS序列长度变异范
围为628～632 bp，平均为630 bp,共有79个变异位点，占12.5%,保守位点553，占87....
枸杞nrDNA ITS测序鉴定的初步研究
枸杞属 ITS序列 DNA测序 鉴定
2009/6/16
[ 目的] 对枸杞nrDNAITS( 核糖体DNA 基因内转录间隔区) 序列进行分析, 从而在分子水平对枸杞做出鉴定。[ 方法] 采用改良
CTAB 法提取枸杞叶片DNA, 利用合成的特异引物对其DNA 中nrDNA ITS 区进行扩增、克隆, 对目的片段测序分析。[ 结果] 克隆到枸杞
nrDNA ITS 片段并获得其碱基序列, 成功找到3 个供试枸杞种质材料的nrDNAITS 序列差异。[...
为从鼠尾草属植物中鉴别丹参品种, 采用基因测序方法, 用核糖体核酸内转录间隔区基因( nrDNA ITS) , 编码核蛋白体大亚基多肽L16 的基因( rpl16 ) 及叶绿体DNA 上包含trnL 以及trnL 和trnF 间隔区的区域基因( trnL- trnF) 的序列, 检测六种鼠尾草属新鲜植物。由于nrDNA ITS 和rpl16 突变率较高, 可以做为6 种鼠尾草的基源鉴定标记, 依此...
小麦族中具ＳｔＨ 基因组的物种被包含在广义披碱草属中。本研究利用ｎｒＤＮＡＩＴＳ序列，采用最大简约法、最大似然法和基于ＭＪ算法的网状结构分析，对１６个不同地理分布和形态特征的具ＳｔＨ 基因组组成的物种及８个含Ｓｔ和Ｈ 基因组的拟鹅观草属和大麦属的二倍体物种进行了系统发育分析。结果表明，１）过去归属于裂颖草属和猬草属的物种大松鼠尾巴草、瓶刷草和猬草与披碱草属物种关系较近，应当划入披碱草属中；２）北美...