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中国海洋大学海洋生物多样性与进化研究所进化基因组学研究团队介绍(图)
进化基因组 研究团队 生物突变 生活史演化
2024/3/5
古DNA研究揭示东亚家猪母系遗传历史(图)
古DNA研究 东亚家猪 母系遗传历史
2023/1/17
规模化牛场犊牛直肠细菌多样性分析
犊牛直肠 微生物多样性 RFLP 16S rRNA序列
2012/3/20
【目的】研究腹泻犊牛直肠细菌多样性,以及与健康犊牛直肠细菌多样性的差异。【方法】通过建立直肠菌群16S rRNA 基因克隆文库,分别用限制性内切酶MspⅠ和HhaⅠ对阳性克隆的PCR 产物进行限制性酶切片段长度多态性(RFLP)分析,通过测定16S rRNA 基因序列,绘制系统发育树,确定犊牛直肠菌群的组成。【结果】腹泻组克隆阳性率达98. 75% (474 /480),优势菌群以乳杆菌属(14%...
寄生原生动物线粒体与适应性进化
寄生原生动物 线粒体 多样性 适应性进化
2010/4/20
真核生物的线粒体一般具有一定的典型的结构和功能。然而,在单细胞的寄生原生动物中却不断发现从数量、结构到功能均与典型线粒体明显不同的线粒体,表现出线粒体的巨大可塑性和丰富的多样性。该文对寄生原生动物中这些多样的线粒体进行了概述,并对形成这种多样性的根本原因,即这些生物对寄生生活微氧或无氧环境线粒体所发生的种种适应性进化进行了分析探讨。
甲胎蛋白分子演化的生物信息学分析
甲胎蛋白 类白蛋白基因家族 生物信息学 进化
2009/11/19
甲胎蛋白(AFP)是类白蛋白家族成员蛋白之一,在生物个体发育以及肝癌发生发展中起重要作用. 为了研究AFP的系统发生,并以此探讨系统发育与个体发育的关系,运用生物信息学手段,分析了不同物种中类白蛋白家族成员的进化关系,并对各分子的白蛋白结构域进行了进化归类.同时,对不同物种的白蛋白(ALB)和AFP之间包含启动子、抑制子和增强子在内的约14?kb的核苷酸序列进行了比较分析. 研究从系统发育的角度阐...
羚牛线粒体DNA和系统进化研究
羚牛 线粒体DNA 多态性 系统进化
2009/10/28
用8种限制酶分析了5种牛科动物,羚牛、黄牛、水牛、绵羊和山羊的线粒体DNA 的多态性。依据数学模型计算这5种动物间的遗传距离,在此基础上构建了UPG 和NJ两种分子系统进化树。结果表明:羚牛与牛和羊的分化时间分别为4.02 Ma和3.72 Ma,因此将羚牛归入羊亚科较为合理。
鸡球虫mt COⅠ基因片段序列的克隆与系统学分析
鸡 球虫 艾美耳球虫 细胞色素C氧化酶Ⅰ亚基 序列分析 系统进化
2009/8/27
利用扩增的鸡球虫线粒体细胞色素C氧化酶Ⅰ亚基(mt COⅠ)基因片段,对鸡柔嫩艾美耳球虫(Eimeria tenella)、毒害艾美耳球虫(E. necatrix)、巨型艾美耳球虫(E. maxima)、堆形艾美耳球虫(E. acervulina)、变位艾美耳球虫(E. mivati)进行系统进化研究。提取5种球虫12个株的总DNA,利用合成的引物进行PCR扩增和序列分析,将得到的序列登录GenB...
线粒体D-loop序列变异与东方鲀属鱼类系统发育
系统发育 D-loop 东方鲀属
2009/8/26
东方鲀属的红鳍东方鲀(Takifugu rubripes)是后基因组时代的一种重要模式生物。本研究中,利用东方鲀属11种鱼类(18尾)的D-loop基因序列,对东方鲀属鱼类的系统发育关系进行研究。经序列比对排定后,分析中D-loop序列有841个位点,其中395个位点为可变位点,267个位点为系统发育信息位点。分别采用邻接法(NJ)、最大简约法(MP)、最大似然法(ML)和贝叶斯方法构建了分子系统...
被子植物镜像花柱及其进化意义
被子植物 繁育系统 镜像花柱 进化
2009/7/21
镜像花柱是指花柱在花水平面上向左(左花柱型)或向右(右花柱型)偏离花中轴线, 是一种花柱多态现象, 可根据左、右花柱花在植株上的排列式样划分为单型镜像花柱和二型镜像花柱两类, 或根据镜像花柱和雄蕊的排列方式划分为雌雄互补镜像花柱和非雌雄互补镜像花柱两类。镜像花柱现象已在被子植物11个科的部分种类中进行了报道, 它在保护功能型雄蕊和雌蕊、通过自交产生繁殖保障效应以及通过减小雌雄功能间干扰、提高异交率...
Myostatin三维结构模建及分子进化分析
肌肉生长抑制素基因 分子进化 同源模建
2009/7/2
Myostatin(MST)为肌肉生长负调节因子,其功能受抑制可导致肌肉量增加。对MST核酸序列进行序列比对,构建进化树;采用同源模建方法首次模建MST成熟肽生物活性二聚体的四级结构,并预测MST与其受体ActRIIB的相互作用模式。进化树将肌肉生长抑制素基因(MSTN)分成4个亚家族:哺乳动物MSTN,鸟类MSTN以及鱼类MSTN 1和2。MST受纯化选择作用,在不同物种的直系同源基因具有较高...
大量研究显示,细菌与真核生物中的许多氨酰-tRNA合成酶(aaRS)在一些细菌与真核生物中的基因进化机制与模式、氨酰化途径、结构与功能的进化模式等方面往往有着明显的差异。通过对这些差异的深入研究,对于理解蛋白质的结构、功能的进化将是非常有帮助的。虽然,造成这些差异的本质,目前仍不清楚,但是,所有的这些差异似乎提示,在细菌与真核生物的一些基本生命活动过程中的某些方面,可能还存在着目前尚未被人们所认识...
斑纹薄鳅(Leptobotia zebra)最初是由Wu(1939)描述的一个新种,当时定名为斑纹沙鳅(Botia zebra),后来Chen(1980)根据眼下刺不分叉将其改归为薄鳅属的物种。本研究通过对线粒体DNA细胞色素b基因序列的测定和分析,发现斑纹薄鳅和薄鳅属(除斑纹薄鳅)物种间的平均遗传距离为0.177,和中华沙鳅属物种美丽沙鳅(Sinibotia pulcher)的平均遗传距离仅为0...
长江口及其南部邻近地区大弹涂鱼种群遗传结构及种群历史分析
大弹涂鱼 细胞色素b RAPD,种群遗传结构 长江口
2009/6/25
应用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术及细胞色素b(Cytb)基因序列,分析了长江口及其南部邻近地区大弹涂鱼(Boleophthalmus pecinirostris)群体遗传结构及种群历史,结果显示这一区域大弹涂鱼群体的遗传多样性水平很高。(1)RAPD分析结果:从100个10碱基随机引物中筛选出30个多态性引物,对长江口九段沙湿地、浙江舟山定海、福建霞浦群体各20个体进行RAPD分析,3个群...