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元宝枫AP2/ERF基因功能研究取得新进展（图）
元宝枫 AP2 ERF 基因功能
2023/5/30
元宝枫（Acer truncatumBunge），属槭树科（Aceraceae）槭树属（Acer），因翅果形状像“金锭元宝”而得名，其抗旱、节水性能力强，是太行山石质山区和黄土丘陵区域重要的造林树种。APETALA2/Ethylene Responsive Factor (AP2/ERF)在植物抵御非生物胁迫中起着关键作用，然而对于元宝枫AP2/ERF的功能却不清楚。
枣AP2/ERF转录因子鉴定及其响应枣疯病植原体表达分析
枣 枣疯病 植原体 AP2/ERF转录因子
2020/9/14
利用生物信息学方法，从植物转录因子数据库和NCBI数据库中分别得到175和164个候选的枣AP2/ERF转录因子序列，使用DNAMAN软件进行序列比对、去除重复序列，采用SMART软件预测蛋白结构域发现，枣基因组中包含有145个AP2/ERF基因，其中ERF、AP2、RAV亚家族分别含有116个、23个、5个，另有1个独立基因。预测枣AP2/ERF转录因子氨基酸数量在111 ~ 692之间，分子量...
基于番茄基因组数据库的更新，系统地对番茄AP2/ERF超家族成员进行了更新，并对其进行了染色体定位、保守基序、基因结构和对灰霉菌及生长素胁迫响应的分析。共鉴定出141个ERF家族基因，其中新鉴定出的ERF亚家族成员42个；随机分布在12条染色体上，大都只含有外显子而无内含子，部分基因不同程度的受到灰霉菌和生长素处理的诱导表达。作为拟南芥AtERF109在番茄中的同源基因，SlERF.D.3的表达可...
用RT-PCR方法从‘大辣椒’蝴蝶兰叶片中克隆得到4个AP2/ERF家族基因，命名为PhAP2/ERF1 ~ PhAP2/ERF4。蛋白结构域和序列比对发现PhAP2/ERF1 ~ PhAP2/ERF4均含有1个AP2结构域， PhAP2/ERF2还含有1个B3结构域。进化树分析表明4个蛋白与兰科AP2/ERF家族成员亲缘关系最近，PhAP2/ERF1属于AP2/ERF家族DREB亚家族中的A1类...
小豆AP2/ERF基因家族鉴定及其应答锈菌侵染的表达分析
小豆 小豆锈病 豇豆单胞锈菌 转录因子
2020/9/2
为明确小豆VaAP2/ERF家族基因在小豆应答豇豆单胞锈菌(Uromyces vignae)侵染中的作用,本研究采用生物信息学方法从小豆基因组中鉴定VaAP2/ERFs家族基因186个,包括AP2(24个)、RAV(2个)、Soloist(1个)及ERF(159个)四个亚家族,其中ERF亚家族又可分为DREB和ERF两个亚类。基因结构分析发现,68.3%的VaAP2/ERFs基因不具内含子。保守基...
14个苹果AP2/ERF转录因子基因的克隆与表达分析
苹果 AP2/ERF转录因子 序列分析 表达分析
2020/4/8
为探究AP2/ERF转录因子在苹果(Malus pumila Mill.)生长发育以及生物或非生物胁迫应答下的功能,本研究利用同源比对和逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)方法,克隆苹果MdAP2/ERF全长cDNA序列并进行生物信息学分析。采用Array技术检测MdAP2/ERF在苹果16种不同组织中的表达情况,RNA-seq技术检测MdAP2/ERF在苹果斑点落叶病菌(Alternaria a...
基于转录组金银花AP2基因家族的生物信息学及表达分析
金银花 AP2转录因子 基因鉴定 表达分析
2020/3/9
为研究金银花AP2转录因子参与低温的应答机制,本研究基于低温下金银花转录组测序数据,利用在线生物信息学工具对金银花AP2转录因子的理化性质、亚细胞定位、磷酸化位点、蛋白基序以及进化分析进行鉴定和分析;利用实时荧光定量PCR检测3个DREB基因和1个RAV基因在低温胁迫下的表达情况。结果表明,在金银花中共筛选了34个AP2转录因子,不同转录因子之间的理化性质存在差异,表明其在不同的微环境中发挥不同的...
调控黄瓜苦味基因Bi的AP2/ERF家族转录因子
黄瓜 苦味 酵母单杂交 烟草瞬时表达 AP2/ERF转录因子
2014/6/13
从华北型黄瓜‘9930’中克隆了黄瓜苦味形成的关键基因Bi的启动子序列，通过酵母单杂交技术对黄瓜叶片cDNA文库进行筛选，寻找可以调控Bi表达的转录因子。通过对筛选结果的测序及比对，发现有7种转录因子重复出现，包括2个AP2/ERF家族、3个bZIP家族、1个WRKY家族转录因子和1个E3泛素类COP1蛋白。其中AP2/ERF家族转录因子CsERF（登录号：Csa7M448110）重复出现6次，出...
以茎瘤芥（Brassica juncea var. tumida Tsen et Lee）‘永安’为材料，通过RACE 和RT-PCR技术得到1 个AP2/EREBP 转录因子基因的cDNA 全长序列和基因组DNA（gDNA）序列，该基因与拟南芥AtABR1 基因的氨基酸序列相似性高达72%，因此命名为BjABR1（GenBank 登录号：JQ713825.1）。BjABR1基因gDNA 序列含1...